Kaito Kuroba, seorang siswa SMU biasa yang ayahnya, Toichi Kuroba, meninggal secara misterius 8 tahun yang lalu. Setelah 8 tahun tersebut, ia dibuat sadar akan identitas rahasia ayahnya, seorang pencuri profesional yang dikenal sebagai Kid si Pencuri Bayangan. Kid dibunuh oleh sebuah organisasi misterius karena menolak untuk membantu mereka dalam mengambil batu permata Pandora, sebuah batu permata mistis yang dapat meneteskan air mata, benda yang menganugerahkan keabadian. Ia bersumpah untuk mencegah organisasi misterius itu mendapatkan keabadian dari batu tersebut. Misi petualangan Kid (yang sekarang Kaito Kuroba) mencuri berlian yaitu untuk mengetahui dalang dibalik pembunuhan ayahnya. Ia selalu mengembalikan barang yang dicurinya selama barang itu bukan berlian yang menyebabkan ayahnya terbunuh. Kaito Kid terkadang menemui Conan Edogawa dalam misinya, dan terkadang juga menemui Saguru Hakuba, teman sekelasnya sendiri yang bekerja sebagai detektif. Saguru selalu curiga bahwa Kaito adalah Kid, namun karena kecerdikan Kaito, Saguru akhirnya percaya bahwa Kaito bukanlah Kid si Pencuri Bayangan.